실험 데이터 분석 가이드
qPCR, 웨스턴블랏, FISH 결과를 정확하게 분석하는 방법을 예시와 함께 단계별로 정리했습니다. 각 글의 계산은 무료 도구로 바로 해 볼 수 있습니다.
qPCR
qPCR ΔΔCt 계산 방법qPCR 상대 정량의 표준인 2^-ΔΔCt(Livak) 방법을 ΔCt, ΔΔCt, fold change 순서로 실제 숫자 예시와 함께 설명합니다. 반복 실험 처리와 흔한 실수까지 정리했습니다.ΔΔCt와 Pfaffl 방법 차이표준곡선 기울기로 primer 효율을 구하는 법(E = 10^(-1/slope)), Pfaffl 공식, 그리고 효율이 달라질 때 ΔΔCt 결과가 얼마나 달라지는지 예시로 비교합니다.qPCR reference gene 고르는 법qPCR 정규화에 쓰는 reference(housekeeping) gene의 조건, 실험 조건별 안정성 확인 방법, MIQE가 권장하는 2개 이상 사용과 기하평균 정규화를 설명합니다.qPCR 반복 실험과 통계qPCR에서 n을 어떻게 세는지(technical vs biological replicate), 통계를 fold change가 아닌 ΔCt·log2FC에 적용하는 이유, t-test와 ANOVA 선택, SD와 SEM 오차막대를 정리합니다.qPCR 데이터 문제 해결qPCR 결과에서 자주 만나는 문제(늦은 Ct, NTC 증폭, technical replicate 편차, melt curve 다중 피크, gDNA 오염)의 원인과 판단 기준, 대처법을 체크리스트로 정리했습니다.
웨스턴블랏
웨스턴블랏 밴드 정량(densitometry) 방법웨스턴블랏 밴드를 정량하는 전 과정을 정리했습니다. integrated density, 배경 차감 방식, loading control 정규화, 기준 lane 대비 상대값, 반복 실험 통계까지 예시와 함께 설명합니다.웨스턴블랏 정량에서 흔한 실수 7가지웨스턴블랏 정량값을 틀리게 만드는 흔한 실수 7가지(포화된 밴드, 조정된 이미지 정량, loading control 포화, 박스 크기 불일치 등)와 피하는 방법을 정리했습니다.논문용 웨스턴블랏 figure 규칙저널이 요구하는 웨스턴블랏 figure 규칙을 정리했습니다. 허용되는 밝기 조정, lane 재배열 시 구분선, 분자량 표시, 원본(uncropped) 블랏 제출, 흔한 지적 사항까지 설명합니다.